高通量超聲波基因組剪切儀又名聚焦超聲波剪切儀,聲波基因組剪切儀,XM-M220單槽XM-ME220雙槽
高通量聲波基因組剪切儀是在傳統(tǒng)超聲波處理基礎(chǔ)上的技術(shù)革新,通過球面固態(tài)超聲換能器將聲波以
三維方式聚焦到樣本區(qū)域,聚焦聲波能夠以不同角度的能量輸入獲得良好的處理效果,避免傳統(tǒng)超聲能
量的不聚集可能引起的樣本處理過度及熱損傷。采用等溫、旋轉(zhuǎn)離心管及非接觸的方式對(duì)樣品進(jìn)行打斷
,勻漿和混合。用于無菌、超微量破碎,隔著離心管能打斷染色體。且不產(chǎn)生感染性飛霧,超聲探頭與樣
品不接觸,避免交叉污染。自動(dòng)聲波聚焦通過精確的控制系統(tǒng)和自動(dòng)化的冷水機(jī)操作,為樣本處理提供
高效可控、重復(fù)性優(yōu)良、溫度恒定及無污染的處理環(huán)境。目前已廣泛應(yīng)用于基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、細(xì)胞
生物學(xué)等研究中。
·更短的波長-低至3mm波長,與生物樣本大小相同數(shù)量級(jí),更容易聚焦。
·更集中的聲波-精確聚焦聲波至樣品區(qū)域,減少能量損失,帶來更低的功耗。
·更安靜更健康-臨床醫(yī)學(xué)級(jí)超聲頻率,處于安全聽力范圍之外,無噪音,對(duì)人體無害。
基本原理:
通過壓電轉(zhuǎn)換器,將電信號(hào)轉(zhuǎn)變?yōu)楦哳l聲波信號(hào),產(chǎn)生數(shù)百萬的分子“空穴”,利用“空穴”在幾秒內(nèi)變大、破裂產(chǎn)生的瞬時(shí)流體剪切力,通過等溫、非接觸的方式對(duì)樣本進(jìn)行打斷、勻漿和混合。
應(yīng)用領(lǐng)域:
組織破碎與勻漿、蛋白質(zhì)提取、蛋白質(zhì)消解、DBS血卡收集提取、MALDI-TOF樣本處理、細(xì)胞及亞細(xì)胞組分裂解、ccfDNA提取、ChIP染色質(zhì)剪切、DNA/RNA提取、生物標(biāo)志物提取、DNA/RNA片段化、FFPE樣本核酸提取、配方設(shè)計(jì)、脂質(zhì)體制備、納米顆粒制備、化合物分散/溶解、藥物合成與微粉化
不同片段化方法的對(duì)比:
超聲波打斷法;
操作簡單,耗時(shí)短,成本低;
隨機(jī)片段化,無GC序列偏好;
剪切效果不受DNA濃度影響;
片段化結(jié)果集中度高.目的長度片段得率高。
酶切法:
實(shí)驗(yàn)要求嚴(yán)格,針對(duì)不同樣本合適的片段化條件摸索不易,成本較高;
存在序列偏好性;
需要根據(jù)樣本濃度改變酶濃度,酶活性易受到溶液成分影響;
目標(biāo)長度片段集中度較低。
傳統(tǒng)探頭和非接觸式的對(duì)比:
傳統(tǒng)探頭超聲波破碎儀
探頭與樣品直接接觸,有金屬離子污染,一次只能處理一個(gè)樣品,實(shí)驗(yàn)周期長。
對(duì)于多個(gè)樣品,需要重復(fù)使用同一探頭,容易造成樣品交叉污染。
由于每次探頭插入樣品的深度不一,每次超聲的能量分布也不盡相同,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性和準(zhǔn)確性。
由于不能采用封閉系統(tǒng),在超聲過程中產(chǎn)生的氣霧或者泡沫會(huì)擴(kuò)散到環(huán)境中,造成潛在的生物危險(xiǎn)。
非接觸式超聲波破碎儀
消除了傳統(tǒng)的手持探頭,固定探頭的繁瑣。
消除了樣品交叉污染的危險(xiǎn);能隔著離心管能打斷染色體、破碎細(xì)胞。
無氣霧浮質(zhì)產(chǎn)生-增強(qiáng)生物安全性.用于無菌操作。
主要優(yōu)勢:
1.通量高:一次可同時(shí)處理30-60個(gè)樣品,實(shí)驗(yàn)效率高
2.無需頻繁操作探頭:各樣品均在單獨(dú)的全封閉試管中,避免交叉污染
3.產(chǎn)品配置豐富,適合于不同樣品的實(shí)驗(yàn):適用之樣本管型式 0.1ml-15ml多種適配器
4.超聲參數(shù)設(shè)置靈活,實(shí)驗(yàn)步驟標(biāo)準(zhǔn)化,實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好,結(jié)果可靠性高
5.無需特殊專用耗材,實(shí)驗(yàn)成本低
6.采用4℃低溫水浴超聲波,能量分布均勻,超聲作用完全,樣品完全在低溫環(huán)境中進(jìn)行,避免了樣品的變性
性能特點(diǎn):
1.無需特殊耗材,操作簡單,時(shí)間快,通常一個(gè)實(shí)驗(yàn)最短時(shí)間只需5分鐘
2.儀器配有旋轉(zhuǎn)馬達(dá),超聲時(shí)自動(dòng)連續(xù)旋轉(zhuǎn)離心管適配器,使超聲能量分布更均勻
3.采用7寸醫(yī)用級(jí)電阻觸摸屏觸控操作,屏幕實(shí)時(shí)顯示工作參數(shù)時(shí)間、溫度、功率及連續(xù)模式和間隙模式顯示,操作簡便,運(yùn)行狀態(tài)倒計(jì)時(shí)顯示
4.微處理器設(shè)有密碼保護(hù)功能,內(nèi)置程序,可根據(jù)樣品類型,輸入不同的程序,達(dá)到實(shí)驗(yàn)?zāi)康?,無需頻繁搜索實(shí)驗(yàn)條件
5.儀器具有超電流、超電壓、超溫報(bào)警功能,當(dāng)溫度超過設(shè)定溫度,自動(dòng)停止超聲并報(bào)警,保證樣品的完整性
實(shí)驗(yàn)效果:
1.gDNA不同起始量打斷效果
可對(duì)不同起始量的樣品體積進(jìn)行打斷,可得到高重復(fù)的DNA剪切結(jié)果,不同初始樣本量均能得到一致性的片段。
2.全血片段對(duì)比:
3.不同投入量和不同超聲時(shí)長的測試結(jié)果:
在投入量分別是200ng時(shí),通過Qsep100片段分析儀檢測,打斷的DNA片段在200-400bp區(qū)間占比分別是
47.7%、49.2%、49.1%;片段平均值分別是290.3bp、287.6bp、283.7bp,
在投入量分別是300ng時(shí),通過Qsep100片段分析儀檢測,打斷的DNA片段在200-400bp區(qū)間占比分別是
49.4%、49.2%、49.3%;片段平均值分別是288.0bp、284.3bp、284.2bp,
說明該儀器打斷效果不錯(cuò),打斷片段峰形為單一峰形,較完整。
4.相同處理時(shí)長的樣本混合后,瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果:
圖2:處理時(shí)長相同的樣本(8組)均勻混合后電泳檢測結(jié)果 Marker 條帶從下往上依次為100bp、200 bp、300bp、400bp(最亮條帶)、500bp、600 bp。
技術(shù)參數(shù):
型號(hào) | XM-M220(單槽) | XM-ME220(雙槽) |
超聲頻率 | 20-400KHz混頻超聲功能,頻率自適應(yīng) | |
總時(shí)間可調(diào) | 0.1s-9999min,脈沖間隙時(shí)間可調(diào):0.1s-99.9s | |
超聲水槽容積 | 15*14*10cm | 23*14*10cm |
進(jìn)口原裝多頻超聲換能器 | 4組 | 8組 |
超聲樣品體積 | 2mL以上或5μL以下 | |
樣本處理數(shù)量 | 32*0.1ml,20*0.65ml,11*2ml以及5個(gè)5-15ml離心管 | 60*0.1ml,40*0.65ml,22*2ml以及10個(gè)5-15ml離心管 |
適配器材質(zhì) | 316不銹鋼材質(zhì) | |
噪音等級(jí) | <55dB | |
冷卻系統(tǒng) | 便攜式恒溫槽主機(jī)(壓縮機(jī)制冷) | |
溫控范圍 | 2-40℃ | |
溫度讀數(shù)精確性 | at 0.1℃ | |
壓縮機(jī)功率 | 600W |
研究領(lǐng)域:組蛋白的修飾研究、染色質(zhì)表觀遺傳修飾研究、轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析、藥物開發(fā)研究、有絲分裂研究DNA損傷與凋亡分析等。